检测马铃薯黑脚病的新工具得到广泛应用

土豆很重要。它们在世界主要农作物中排名第四。在美国，它们在30个州进行商业化种植，每年价值40亿美元。马铃薯还易受160种不同的真菌，细菌和病毒性疾病(例如黑腿病和软腐病)的影响，这些疾病是由迪卡奇菌(Dickeya dianthicola)细菌引起的。

2015年，该细菌的暴发导致损失超过4000万美元。造成这种暴发的部分原因是，当使用基于DNA的测试对种土豆进行病原体筛选时，无法检测到这种特定细菌。

为了防止再次发生这种规模的爆发，科学家开发了一种用户友好的在线工具Uniqprimer，该工具可以快速，自动地设计物种特异性的DNA标签(也称为引物)，以使用DNA测试来检测病原体。

为了测试Uniqprimer，科学家们筛选了116个野外样品中是否存在D. dianthicola，并在来自九个不同州的样品中发现了它。当其他更常用的测试未检测到时，Uniqprimer能够检测到该细菌。

Uniqprimer在开发时考虑到了黑腿病和马铃薯，但可以应用于任何病原体和任何地理区域。任何有互联网连接的人，甚至没有生物信息学背景的人都可以使用它。

主要作者Shaista Karim说：“我们希望Uniqprimer及其设计的测试将有助于准确地检测出D. dianthicola和许多其他病原体。” “准确的病原体检测是控制疾病的第一步，这有助于减少马铃薯产业的损失，并及时通知农民，以更好地帮助农场决策。”

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