科学家发明了节省时间的技术以显示细胞如何分化

医学2020-09-04 12:45:43
导读芝加哥大学分子工程研究所的研究人员开发了一种新的芯片实验室,可以在一周的时间内检测数千个单独的活细胞,进行的实验需要超过100万步。

芝加哥大学分子工程研究所的研究人员开发了一种新的“芯片实验室”,可以在一周的时间内检测数千个单独的活细胞,进行的实验需要超过100万步。实验室。

信用卡大小的微流体设备不仅节省了时间和金钱,而且还提供了单个干细胞如何对不同分子和环境作出反应的新视角。

当研究人员检查设备上的神经干细胞并分析数据时,他们发现了几个新规则,这些规则决定了导致细胞分化或自我更新所需的时间和信号序列。该发现可能对理解大脑发育或用免疫疗法治疗患者有影响。

“我们希望开发一种微流体装置,能够以自动化,高通量的方式对单个细胞进行分类,成像和培养,”Assoc说。该研究的第一作者Savas Tay教授于4月3日发表在“科学进展”杂志上。“我们实现了这一目标,现在我们已经了解干细胞如何做出决定。这非常令人兴奋。”

开发一种研究细胞的新方法

我们体内的细胞不断响应不同的信号和环境的变化。例如,在干细胞中,在不同时间点接收的信号决定了细胞如何选择它将发育成哪种细胞。一个信号可能导致干细胞分化成另一个细胞,而另一个信号可能导致它保持其形态。

研究人员目前无法在体内的单个细胞上研究这些信号分子。这种分析可以在实验室中通过昂贵,耗时的实验来完成,但它们最终无法测试所有可能的结果。

微流体装置具有微小的腔室,通道和阀门,为研究人员提供了一种更快速,自动化的方法来研究细胞中的这些反应。但是这些装置提供了有限数量的腔室 - 这意味着研究人员只能测试每个细胞的一定条件 - 并且无法使细胞保持足够长的时间以便长时间研究它们。

找到一种方法来保持挑剔的细胞活着

泰和他的合作者开始改变这种状况。他们设计了一种微流体装置,其具有1,500个自动化室 - 远高于类似装置,其低于100.该装置还可以进行若干任务,如细胞刺激,培养,成像和分选 - 这些任务之前已降级为单独的装置。它可以以不同的模式培养细胞 - 这意味着它可以同时检查不同类型的细胞。

最后,由于采用了将培养基扩散到细胞培养物中的新技术,该装置还可以使细胞保持更长时间。通常,为了保持细胞存活,研究人员必须每隔几个小时更换一次所保存的培养基。这种变化会震动细胞,经过几次冲击后,细胞就会死亡。研究人员的新技术将介质扩散到细胞室中,这是一种不会对细胞产生冲击的更温和的过程。

在该装置的第一次实验中,研究人员研究了不同的信号分子如何影响小鼠神经干细胞的结果。这些实验产生了数百万个数据点,因此Tay与UChicago医学和遗传学教授Andrey Rzhetsky合作,对大型数据集进行了机器学习分析。

他们发现某些信号组合会协同作用并导致细胞分化,而其他分子会关闭这些过程。这些信号的时间也至关重要。研究人员发现,如果在正确的时间输送分子,它可以改变干细胞的过程,从分化到自我更新。

“有一些信号是非常优化的,信号的确切时间很重要,”Tay说。“以前没有办法动态监测这些细胞,所以找到并理解这些原理是令人兴奋的。”

接下来,研究人员希望利用该装置研究类干细胞,这些组织来源于干细胞,它们像微小器官一样组织起来。

最终,像这样的设备可用于免疫疗法等领域,在这些领域,患者自身的免疫系统受到刺激,有助于对抗疾病。可以移除患者的干细胞,将其置于装置中并给予正确的分子组合以将它们发育成某一谱系,然后将其放回体内。

“我们希望能够将这种装置用于细胞生物学中的各种问题,”Tay说。

论文的其他作者包括Ce Zhang和Tsi的Hsiung-Lin Tu,他们是Tay实验室的前博士后研究员;Gengjie Jia,Rzhetsky实验室的博士后;以及巴塞尔大学的Verdon Taylor和Tanzila Mukhtar。

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