希望之城和转化基因组学研究所(TGen)的专家正在使用世界上最全面的基因组分析工具之一，为转移性肾癌患者制定个性化治疗计划。

尽管医师科学家正处于漫长旅程的开始，但他们相信自己走在正确的道路上。他们最近在《癌症免疫疗法杂志》上发表了一项研究，该研究表明TERT基因的突变预示着患者可能无法接受免疫检查点抑制剂(如nivolumab或pembrolizumab)。

“我们希望有一天能确定哪些患者将从免疫疗法中受益，哪些人将从免疫疗法中受益。最终，我们也许能够区分出哪位患者更适合于其他疗法，例如靶向疗法，”医学博士之一的Sumanta Pal说道。该研究的资深作者和希望之城的肾脏癌计划联合主任，该市是世界著名的癌症，糖尿病和其他威胁生命的疾病的独立研究和治疗中心。靶向治疗的例子包括血管内皮生长因子(VEGF)酪氨酸激酶抑制剂，如卡博替尼。

据美国癌​​症协会称，今年将诊断出近74,000例新的肾癌病例，约有14,800人死于该病。具有讽刺意味的是，专家们知道具有某些基因突变的患者更易受特定药物的影响，但大多数医生并未对每位肾癌患者的肿瘤进行基因测序。

他补充说：“这是一个悖论：我们没有以针对性的方式使用针对性的疗法。”“在希望之城，我们已开始为所有患有4期癌症的患者提供全面的基因组和外显子组测序，无论其癌症部位如何。”

希望之城(City of Hope)有望成为美国唯一能够对每位患者的肿瘤进行遗传学分析的主要癌症中心，无论其癌症类型如何。目的是使患者能够接受有效的靶向治疗或尽早使人们参加创新的临床试验，以便他们可以抗击疾病。

在这项研究中，Pal和他的同事将91位患者的肿瘤样本发送到TGen的临床实验室Ashion Analytics，以便可以利用GEM ExTra对这些样本进行测序，该工具具有肿瘤正常的全外显子组测序和肿瘤的整个转录组功能排序。这些是每个患者整个蛋白质编码DNA和RNA的分子水平分析。

TGen整合癌症基因组学部助理教授，该研究的共同作者，萨拉·拜伦(Sara Byron)博士说：“目标是确定与治疗反应相关的基因组改变。”“我们希望利用这一'真实证据'来探索与反应相关的潜在分子和基因组特征。”(Ashion Analytics最近宣布，Medicare已经批准了GEM ExTra的承保范围，有可能使另外4400万患者接受此测试，目的是使患者接受针对其疾病的最佳可用治疗方法。)

自2015年以来，涉及靶向治疗或免疫治疗的肾癌治疗方案已经迅速发展。由于新疗法的发展如此迅速，科学家尚未找到对方案进行测序以实现最佳结果的理想策略。此外，该研究报道，目前评估治疗风险的方法往往带有主观的偏见。希望之城(City of Hope)和TGen正在努力开发针对肾脏癌的客观的基于实验室的生物标记。

该研究仅包括在全身治疗之前进行基因组分析的患者。患者接受靶向治疗，称为VEGF酪氨酸激酶抑制剂(舒尼替尼，卡博替抗，lenvatinib /依维莫司)或免疫治疗(nivolumab，ipilimumab，pembrolizumab)。将他们分为没有临床受益(意味着疾病进展)或获得临床受益(意味着疾病缩小或稳定了六个月以上)的患者。分析了大约19,396个基因和核酸序列，以根据他们的特定肿瘤突变，制定出最适合每个患者的治疗方案。需要对更大样本量进行更多研究，但科学家们有一个良好的开端。

帕尔说：“第四阶段的癌症通常被认为是无法治愈的，但并非总是如此。”“通过对所有编码蛋白质的DNA进行测序，即对整个外显子组进行测序，我们也许能够确定新的治疗靶点，这是一个非常令人兴奋的前景。”