研究人员是如何识别可推动脑瘤发展的基因

乌普萨拉大学的研究人员已经开发出一种方法，用于鉴定功能性突变及其对与胶质母细胞瘤发展相关的基因的影响-胶质母细胞瘤是一种预后很差的恶性脑肿瘤。该研究发表在《基因组生物学》上。

人类基因组由近22,000个基因组成。许多研究已经探究了我们生产蛋白质的DNA的近2%。对于不编码蛋白质的98%的信息知之甚少。但是，这些非编码区包含重要信息，并调节基因在不同组织，不同发育阶段以及癌症等疾病中是否活跃。

癌症是由导致细胞分裂不受控制的突变引起的。胶质母细胞瘤是最具有侵略性的癌症之一，它是脑肿瘤的一种形式，预后很差。关于非编码区的突变如何驱动胶质母细胞瘤的知之甚少。为了弥补这一知识鸿沟，乌普萨拉大学的研究人员对成胶质细胞瘤患者肿瘤组织中的DNA进行了全基因组测序，并分析了鉴定出的突变。

免疫学系Karin Forsberg-Nilsson教授说：“我们的主要任务之一是识别与调控元件相关的功能性突变以及与癌细胞发展的潜在相关性，并将它们与所有随机变异区分开来，而没有任何假定的意义。”乌普萨拉大学遗传与病理学。

研究人员认为，在整个进化过程中在哺乳动物中保持不变的DNA序列可能具有重要的功能。因此，他们将有关突变所在的遗传区域的进化保守性信息与他们发现的数千个突变相交。

乌普萨拉大学医学生物化学与微生物学系和布罗德研究所的Kerstin-Lindblad-Toh教授说：“我们选择将重点放在保存最完好的遗传区域中可能影响基因调控的突变子集上。” (我们)。

研究人员使用SEMA3C基因验证了他们的结果，部分原因是他们在该基因附近的非编码调控区发现了大量突变，部分原因是先前的发现表明SEMA3C与不良的癌症预后有关。

“我们研究了非编码区的突变如何影响SEMA3C的功能和活性。我们的结果表明，SEMA3C附近的一种特定的，进化保守的突变破坏了某些蛋白质的结合，这些蛋白质的任务是结合基因并调节其活性。”福斯伯格-尼尔森说。

这项研究还确定了其他200多个在相关区域富集非编码突变的基因。这些可能具有调节潜力，因此进一步增加了与脑肿瘤的发展有关的基因数量。

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