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科学家希望利用能够分解木材中木质素中最丰富的生物质的
科学家希望利用能够分解木材中木质素中最丰富的生物质的真菌。木质纤维素可用于制造生物制品聚合物的结构单元。了解真菌酶如何分解木材的关键是检查基因表达模式。
通常将这些模式与所谓的“管家基因”进行比较。管家基因以可靠,稳定的水平表达。但是其他真菌中的常规管家基因在木材分解真菌中并未稳定表达。在最近的一项研究中,科学家发现更好,更稳定表达的管家基因可以可靠地测量这些重要真菌整个基因组中的基因表达。
分解木材的真菌有效地解构由自然界中最丰富的碳源之一木质纤维素制成的植物细胞壁。这种能力使这些真菌成为吸引人的靶标,以寻找将木材分解成用于开发生物产品的化学构件的酶。多年来对这些真菌用于其他目的的研究已经获得了丰富的RNA测序数据。科学家正在利用这些数据来发现强大的管家基因,这将使它们能够更准确,更快速地确定将释放这些真菌潜能的关键酶。
明尼苏达大学的科学家与太平洋西北国家实验室的同事合作,从先前关于木材分解真菌的实验中提取了RNA测序数据。他们专注于基因表达对变化的环境做出的响应,例如各种碳源和不同培养条件下分解的不同阶段。他们从褐色腐烂菌Rhodonia(Postia)胎盘开始,使用环境分子科学实验室EMSL的下一代高通量测序系统,以高准确性鉴定了七个有希望获得更好内部控制基因的基因。进一步研究,在木材中同时使用白腐病和褐腐病真菌的其他物种,产生了11种这样的基因。这些基因一起可以提供合适的参考基因,以准确量化DOE任务的相对基因表达。
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