一个数字可以帮助生物医学数据科学家找到致命的癌细胞

医学2020-09-30 14:16:52
导读斯坦福大学医学院的生物医学数据科学家表明,细胞用于制造RNA的基因数量是细胞发育状况的可靠指标,这一发现可以使其更容易靶向致癌基因。

斯坦福大学医学院的生物医学数据科学家表明,细胞用于制造RNA的基因数量是细胞发育状况的可靠指标,这一发现可以使其更容易靶向致癌基因。

引发癌症的细胞被认为是干细胞,是难以发现的细胞,它们可以自我繁殖并发展或分化为更专门的组织,例如皮肤或肌肉-或当它们变坏时会变成癌症。

目前,靶向疗法集中于特定的基因或分子,其中绝大多数可能对癌症干细胞不具有特异性。通常,这些疗法不会持续很长时间。但是,如果您能够识别出分化程度最低的细胞,然后寻找特异于它们的标记,那么寻找目标基因就不再是一种猜测游戏。”

亚伦·纽曼(Aaron Newman)博士,生物医学数据科学助理教授,干细胞生物学与再生医学研究所成员

该研究的发现也具有重要意义,因为鉴定各种组织类型的干细胞是再生受损或功能异常的组织的重要步骤。

科学家展示的是,随着干细胞分化程度越来越高,越来越像成年细胞,它们表达的基因越来越少。以前,其他研究人员已经注意到这种相关性,并认为这可能是一个有趣的巧合。但是纽曼和他的同事们是第一个在公共数据库中对成千上万的单细胞基因测试进行分类,并证明这种模式是一致和可靠的。

纽曼和医学博士的学生Gunsagar Gulati将细胞中表达的基因数量的测量结果与每个基因产生的RNA拷贝数的测量结果结合起来,以此作为计算机算法CytoTRACE的基础,该算法旨在确定发育中的细胞如何发育。

描述该研究的论文将于1月24日在线发表在《科学》杂志上。纽曼是资深作家。该研究所的讲师Gulati和Shaheen Sikandar博士共同担任主要作者。

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