微生物暗物质支配着地球的环境

医学2020-10-25 14:00:06
导读 根据mSystems发表的一项新研究,未培养的微生物 - 那些其特征从未被描述过,因为它们尚未在实验室培养中生长 - 可能在地球上几乎所有

根据mSystems发表的一项新研究,未培养的微生物 - 那些其特征从未被描述过,因为它们尚未在实验室培养中生长 - 可能在地球上几乎所有的环境中都占主导地位,除了人体。

该研究由田纳西大学诺克斯维尔微生物学系副教授Karen Lloyd领导。劳埃德的研究是第一次估计未培养的微生物种群。

科学家们早就意识到这种未培养的微生物,科学家们也将其称为微生物暗物质。然而,一个接一个地计算它们将是一项不可能完成的任务,到目前为止,研究人员甚至无法估计它们中有多少。

劳埃德和她的团队现在有了一个答案:他们相信地球上多达四分之一的微生物可能来自大约30个门 - 一个从未培养过的王国和类别的微生物之间的分类学分类。

劳埃德用一个例子说明了这一点:“所有脊椎动物,每一只有脊柱的动物都被包含在一个门内。因此,这意味着我们可能有30种不同类型的微生物,每种微生物都与任何已知的微生物不同,因为长颈鹿来自海星。“

为了估计有多少未培养的微生物称这个星球为家,Lloyd和她的团队收集了全世界研究人员在公共数据库中保存的每个DNA序列,共计150万,并将它们与26,000个已经培养的微生物和细菌DNA序列进行比较。

“我们很快就遇到了严重的计算限制,但幸运的是,我们与橡树岭国家实验室的计算科学联合研究所进行了很好的合作,”劳埃德说。“他们能够提供完成工作所需的计算能力。”

对未培养的微生物的研究和表征可以是特定领域中特别有价值的工具 - 例如在医学中,科学家已经描述了培养抗性病原体的病例。

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