调查发现免费工具简化了癌症研究

每个细胞都包含大量蛋白质，每种蛋白质都有特定的功能，例如作为另一个分子的受体或催化化学反应的酶。这种机制的紊乱会严重影响细胞并引起疾病，例如癌症，其中，患病细胞的功能与健康细胞的根本不同。因此，一种药物以蛋白质为靶标是非常普遍的，该物质会抑制或刺激其产生或吸收。同时，有许多批准的药物对某些疾病具有经过验证的作用，但没有已知的蛋白质靶标。对于这种物质，据说其作用机理是完全或部分未知的。

因此，科学家对开发一种相对简单的方法感兴趣，该方法能够确定哪种蛋白质受某种药物影响。一些这样的方法已经可用，但是都有缺点。Karolinska Institutet的研究人员现在已经利用这些方法来创建一种新工具，该工具可以提供更加可靠和精确的结果。

研究人员通过对用56种不同药物治疗的肺癌细胞进行实验来开发他们的方法。对于每种药物，他们首先计算出48小时后杀死一半细胞的剂量(LC50)，然后将此剂量用于​​所有药物。一旦一半的细胞死亡，他们将检查每个细胞的蛋白质组(即存在哪些蛋白质及其丰度)，以确定药物靶向的蛋白质。在进一步的实验中，他们在乳腺癌和肠道肿瘤的其他细胞上测试了该药物，并得出了关于该药物在靶向癌细胞方面具有特异性或普遍性的结论。

这些实验的结果在研究人员现在创建的可搜索数据库中进行了描述(请参见下面的链接)，而该方法本身在《自然通讯》上发表的文章中进行了详细介绍。这个想法是让其他研究人员能够使用相同的模型对其他药物进行类似的实验，从而用更多的靶蛋白来扩展更多物质的数据库。

Karolinska Institutet医学蛋白质组学教授Roman Zubarev说：“我们发现细胞被不同的药物杀死的方式不同。”“不久前，我们曾经以为细胞只能以三种方式死亡-坏死，凋亡或自噬-但现在我们已经观察到至少十三种不同的细胞可以死亡的方式。这种方法可以帮助加速某些部位新药开发过程或增进我们对现有药物的了解。”

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