褐鳟基因组将有助于解释物种的遗传超级大国

在Wellcome Sanger研究所的科学家及其合作者完成褐鳟参考基因组后，鱼类种群的养护和管理工作正在酝酿之中。该基因组将有助于解决关于物理变化的褐鳟鱼实际上是单个物种还是几个物种的长期争论，并深入了解它们快速适应多种环境的能力。

新测序的褐鳟鱼基因组将使科学家和保护主义者能够更好地了解这种高度专业化的物种的遗传根源。它将使研究人员能够识别目前归类为褐鳟的任何亚种，促进在气候快速变化期间针对特定种群的保护工作。

褐鳟(Salmo trutta)是最具遗传多样性的脊椎动物之一。分类学家曾将该物种归类为多达50种不同的物种*。不同的人口已经适应了特定的生物生态位，其中一些生活在200米长的淡水流中，而其他人则从他们出生的河流迁移到公海。

这些不同的生命策略有助于解释褐鳟的遗传“超级大国” - 特别是允许它们在海洋和淡水环境之间移动的适应性。由于这种特性，褐鳟是最后一个冰河期结束时从海中重新定殖以前冷冻淡水区的物种之一。

然而，科学家们认为我们可能过于草率地将所有褐鳟鱼种群集中到一个物种中 - 结果是有效的保护和管理是有限的，而不知道物种的精确生命周期和习惯。

贝尔法斯特女王大学生物科学学院的Paolo Prodohl教授现在可以将他认为来自不同物种的褐鳟DNA与参考基因组进行比较，他说：“新的褐鳟参考基因组对我们来说是一个改变游戏规则的因素。 - 我们终于能够解决关于有多少种褐鳟鱼的争论。如果你认为在保护方面，如果你将不同的物种作为一个物种管理，它实际上会破坏你想要的东西因为你不能保护你不知道的东西。“

褐鳟参考基因组将使科学家能够对来自不同种群的DNA进行取样和解码，并与整个基因组序列进行比较，提供回答亚物种形成问题所需的数据，并了解特定的遗传变异如何允许某些鳟鱼生活在栖息地中。对别人来说是致命的。例如，确定苏格兰鳟鱼适应生活在相对酸性水域的遗传变异可能有助于指导保护工作，以保护受全球供暖导致的河流和海洋酸度增加影响的人群。

由于褐鳟的遗传复杂性和多样性，其基因组中有38到40条染色体和多个染色体拷贝*，只有一组染色体的标本是由挪威海洋研究所特别培育的。Wellcome Sanger研究所的科学家从这些标本中提取DNA，并使用PacBioSMRT®测序技术生成第一个高质量的褐鳟参考基因组。

挪威海洋研究所的首席科学家汤姆·汉森(Tom Hansen)表示：“鉴于野生棕色鳟鱼的变异性，重要的是我们可以创造一些基因相同的个体。”建立参考基因组。现在我们拥有基因组，我们可以开始更多地了解鳟鱼如何适应不同的条件，帮助管理未来的野生和养殖鱼类。“

作为桑格研究所25周年25基因组项目的一部分，褐鳟是25种英国物种之一。25基因组计划**包括灰松鼠，红松鼠，金鹰，黑莓和罗宾等物种。该项目为雄心勃勃的达尔文生命之树项目***奠定了基础，该项目将对英国所有60,000种复杂物种进行测序。

高质量的基因组将为科学家们打开大门，让他们利用这些信息来发现英国物种如何应对环境压力，以及他们在遗传学中保持什么秘密，使他们能够蓬勃发展或挣扎。

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