关于好奇Dicyemida的寄生的教训

地球上生命形式令人难以置信的多样性使查尔斯达尔文注意到，“从如此简单的开始，无尽的形式，最美丽，最精彩的已经，并且正在进化。”为了真正理解进化的力量和局限性以产生这种“无穷无尽的形式”，研究生命树中的各种生物是很重要的。幸运的是，新一代测序技术已经能够对几乎任何生物体进行深入的基因组分析，从而扩展了强大的进化分析范围，超越了模式生物。例如，采取绝对不寻常的动物，Dicyemida。

Dicyemida是微观生物，每个仅由约30个细胞组成(图1)。它们是寄生虫，生活在头足类动物的肾囊内，如鱿鱼和章鱼，从宿主的尿液中获取营养。尽管生命周期相对复杂，但双鱼类缺乏分化组织，例如消化道和循环系统，因此代表了动物体内计划减少的最极端情况之一。由于它们的体积小和简化的组织，曾被认为代表了单细胞和多细胞生物之间的联系。然而，他们真正的系统发育位置长期以来一直被认为是有争议的，并且只有在2017年获得博士学位才​​能解决。冲绳科学技术研究生院的学生Tsai-Ming Lu和Drs。神田幸，敬之佐藤，和秀隆古屋，用于转录组数据，以确定地放置菱形动物门的组内Spiralia，具有分段蠕虫，扁虫，和软体动物(Lu等人。2017年)沿。

现在，同一组研究人员通过对Dicyema japonicum的完整基因组进行测序，扩展了他们对该谱系的分析。结果发表在Genome Biology and Evolution的文章“Dicyemid mesozoans：一种独特的寄生生活方式和一种简化的基因组”中，提供了对这种奇怪的生物体的进一步了解，并揭示了寄生虫在一般情况下共享的趋同模式。

在35个动物门中的15个中观察到寄生，并且被认为已经独立地进化了200多次。虽然每个寄生事件反映了宿主和寄生虫之间的特定相互作用，但寄生虫通常具有某些特征，例如简化的身体计划和复杂的生命周期，这些特征反映了与其他生物“谋生”的生物体通常经历的选择压力。。为了理解寄生的演变，作者试图探索使这种生活方式成为可能的基因组创新。这组作者说，“解码双粒子基因组不仅提高了我们对双叶类生物学的理解，例如它们复杂的生命周期，而且为我们提供了丰富的比较研究资源。从基因组的角度[更好地理解]螺旋体的进化。“

考虑到这些目的，日本对虾基因组的测序表明，与其他寄生虫一样，它具有减少的基因组，仅有约5,000个基因。这仅包括四个Hox基因，高度保守的基因，对描绘动物身体计划至关重要。特别是，作者指出，“与其他螺旋寄生虫中减少的基因组相比，双鱼类具有更少的基因和极短的内含子大小(~38 bp)。”减少的基因组往往在寄生虫中广泛存在，允许它们通过减少必须维持的遗传物质的数量来限制能量消耗。

为了确定进化如何推动遗传物质的丧失，研究人员调查了哪些基因在全基因组范围内保留或丢失。而不是消除整个代谢途径，似乎个体Dicyema基因从各种途径中丢失，导致流线型和简化的途径。关于保留的基因，作者指出“一些基因的保留可能表明它们的基本功能是由多种途径共享的。”然而，这提出了哪些途径保持功能的问题，尽管不完整以及双鱼类如何克服由丢失的基因引起的生理缺口。

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